巢囊肿是否影响生育取决于囊肿的大小，位置，性质，如果是单纯的囊肿且不太大，通常对生育没有影响，不需要治疗;如果囊肿较大或双侧都有囊肿，有可能妨碍输卵管拾卵，有可能影响受孕;如果囊肿占据了整个卵巢的位置，这个就会对生育有影响了，即便是已经怀孕的人群，也有可能对妊娠造成影响。