多由细小支气管的炎性病变引起，如反复发作的肺炎、肺结核、哮喘、长期吸烟史、有害粉尘刺激、大气污染等。同时患者多伴有α-胰蛋白酶的缺乏。小气管反复长期炎症，粘膜水肿，分泌物滞留，可形成活瓣，导致空气只能进入肺泡而不能排出，远端肺泡内压力不断升高，形成肺气肿，当肺泡间隔破裂，互相融合，形成含气囊腔，则形成肺大疱。

肺大疱在病因上分为先天性和后天性，但是在表现上基本类同，在医生鉴别先天性和后天性肺大疱时，常根据病人的发病年龄、有无炎症病史或是否伴有慢性弥漫性阻塞肺疾病等，粗略估计。