大多数男性患上性功能障碍的原因并非器质性病变，主要是中枢神经引起的，所以在治疗时期的心理治疗是非常重要的。在开始阶段是缓解焦虑，然后就重建行为模式。经典的冲击疗法、系统脱敏等均可应用。评估病人在各个等级的情境中，产生焦虑的程度、合并使用药物、催眠或肌肉松弛技术等对抗焦虑。此外，自我表露训练等方法有助于病人更坦率地表达自己的性要求。以精神分析结合行为治疗、药物治疗、集体治疗等方法，消除对惩罚的恐惧、对伴侣的不信任、害怕生殖器残缺不全等观念。夫妻同治，不局限于某一学派或方法，而是集各家所长，对性功能障碍进行有效的、综合的、有步骤的、短期而直接的治疗。有4个特点：夫妇均需治疗；帮助他们通过言语或行动更好地交流性的情况；学习性交的解剖生理学；给予分等级的性技术作业。