1、自然因素所致

甜瓜受高温、干旱及长期阴雨天气等自然因素的影响，导致生长缓慢，不易吸收水分和养分，累积了大量的苦味素，较难储存糖分，因此，味道带苦。

2、人为因素

如果甜瓜在生长过程中，过量施用氮肥，可能会导致成熟后带有苦味。另外，未成熟的甜瓜果皮上带有大量的苦味素，若采用化学物质催熟，会使苦味素不能完全转化，因此，果肉味道较苦。

3、正常现象

甜瓜的瓜瓤味道甘甜，清香多汁，但是瓜蒂处味道是苦的，因为，甜瓜的瓜蒂中含有葫芦素B，食用葫芦素B，容易导致中毒。