双侧输卵管堵塞最常见的原因是输卵管或盆腔腹膜炎症所导致。因为炎症会使输卵管黏膜破坏而形成瘢痕，从而引起管腔狭窄或堵塞。

结核菌的感染是一个最主要的病因，结核性引起的双侧输卵管的堵塞是非常常见的。

人工流产后引起的急性盆腔炎、输卵管炎导致双侧输卵管的堵塞也是屡见不鲜的现象。

还有一些致病菌，如葡萄球菌、链球菌或淋病球双菌经过阴道、子宫颈及子宫蔓延到输卵管或盆腔，引起盆腔腹膜炎及全身严重的感染导致双侧输卵管的堵塞。