在胚胎发育的早期，特别是妊娠31-64天期间，是胚胎分化和形成的关键时期，是胚胎高敏阶段，此时B超检查有可能造成胚胎的发育异常。因为B超检查可能会造成胚胎的发育异常。
B超所使用的高频超声波，波长短，能量集中，强度大，震动剧烈，会引起许多特殊作用，结果可能产生机械、热、光、电、化学剂生物等多种效应。
美国专家做动物实验表明，妊娠大鼠在孕早期连续接受超声波扫描后，老鼠胎儿出生后体重下降。湖北医科大学对怀孕6-9周的孕妇做超声扫描后，取容貌组织分析，发现姐妹染色体交换（SCE）升高是染色体DNA受损的敏感指标。北京天坛医院的研究也证明，B超检查对早孕期容貌超微结构、细胞膜有直接损害作用。
因此，早孕妇女应该慎用或者不做B超，如果有明显适宜症要做，应该以少剂量、小辐射和最短的辐射时间为好。