新生儿溶血症的发病原因主要是血型不合，通常最主要是下面两种血型不合。

（1）RH血型不合

我国RH血型不合引起的新生儿溶血症几率比较低，一般是指母亲血型为RH阴性，胎儿的血型为RH阳性导致的血型不合。通常情况下第一胎不发病，从第二胎开始发病。如果母体（RH阴性）接受过RH阳性输血，则也可能发病。

（2）ABO血型不合

ABO血型不合是最常见的血型不合，多是母体O型，胎儿A型或者B型，这种情况第一胎就可发病，分娩次数越多，发病几率越高，且情况一次比一次严重。