蕨菜致癌最主要的原因是蕨菜体内的一种名为原蕨苷的物质，原蕨苷被世界癌症阻止评级为2B类致癌物，蕨菜的根茎叶部分都含有原蕨苷，其中根茎含量多余叶子，致癌物分为四级，2B类致癌是指对人类和动物很有可能是致癌物，此类致癌物对人类的致癌证据是有限的。