本病起病急，1-2天内体温升高达39,伴有头痛、恶心、呕吐、乏力、嗜睡。于病程第4-10日，病情发展至极期，持续高热不退，伴有剧烈头痛、呕吐及意识障碍，由烦躁不安、嗜睡、意识模糊、谵妄至昏迷，频繁抽搐，可表现为深度昏迷，呼吸节律不规则，呼吸暂停,甚至出现呼吸衰竭。患儿可伴有胃肠道症状，如恶心、呕吐、腹泻等，部分患儿可不发生惊厥。多数患儿在病程第8-11日体温逐渐下降，神志逐渐转清，可2周左右完全恢复。5%-20%患儿可留有后遗症，与病情轻重有密切关系，少数患儿在病程6-12个月后，仍留有神经症状，进人后遗期，如经过积极治疗，可一定程度的恢复。