在诊断功能性消化不良之前，有必要进行胃镜检查，尤其是如果出现了上文提到的报警症状（例如近期明显消瘦、黑大便、贫血而且原因不清楚）时、或者消化不良的症状经过治疗缓解不明显、或者是患者有胃癌家族病史、检查肿瘤标志物逐渐升高、以及患者是年龄较大的老年人等情况时，上述情况都需要通过胃镜检查来了解有无食管、胃、或者十二指肠疾病的可能性。