无痛肠镜的禁忌症除了常见的普通肠镜的禁忌症外还应注意相应的麻醉风险。以下情况存在时，麻醉风险大，不建议或者不能采取无痛肠镜。

（1）生命体征不稳定，患者处于休克等危重状态下；

（2）有严重的心血肺功能障碍疾病史，不能耐受麻醉者，比如心肌梗死、严重的高血压、肺心病患者；

（3）对麻醉药过敏者；

（4）伴随有胃潴留或严重吞咽困难，容易发生误吸者，