以下两种情况应该与包茎仔细鉴别：

（1） 包皮过长。包皮过长的情况下，可以用手将包皮翻开完全露出龟头，而包茎则不能；

（2） 隐匿性阴茎。此种类型最容易与包茎混淆。较胖的儿童容易发生隐匿性阴茎，并可以合并包茎。两者外观上较类似，但仔细检查可发现隐匿性阴茎的包皮内空虚，用手很难摸到阴茎体。隐匿性阴茎与包茎需要仔细鉴别开来，因为两者的手术方式截然不同，如果隐匿性阴茎被误当做是包茎治疗，其结果是隐匿的阴茎发育限制问题没有解决，完好的包皮却被切除了，从而给后续的整形造成了极大的困难，所以在行包皮环切术前应严格鉴别这两种疾病。