由于进行肠道准备需要摄入大量的水，所以以下情况下禁止使用口服的方式进行肠道准备：肾脏衰竭、血液透析、肝硬化伴或不伴腹水、充血性心力衰竭以及服用某些特定药物的病人。以上情况如果需要做肠镜的话，可以采取灌肠的方式，但是仍有很大的风险，应该由主管医师评定。