黄热病有明显的季节性，一般春季和秋季为高发期，可在人群中引发爆发性的流行，如著名的1793年费城黄热病大流行。目前，黄热病流行于美洲和非洲的热带及亚热带地区，旅行者中亦有病例报道。据世界卫生组织估计每年约有20万例患本病，人群主要分布在撒哈拉以南的非洲地区。