若服用剂量较小，如果能够度过第一阶段，可在3-5天后会出现肾小管损害所致的肾衰和肝细胞损伤，出现蛋白尿、血尿、脓尿等症状表现。肝细胞损害一般不严重，肾功能损害亦可在数天内逐渐消失，有的表现非常轻微，甚至没有肾损害的表现。

误食百草枯后对肺脏的损伤是非常严重且不可逆的。通畅在吞服百草枯2-4天后出现肺水肿、肺出血、咳嗽、呼吸困难和呼吸急促等症状，但也有些能够延迟到14天才出现。出现进展很快的紫绀，常发生昏迷，然后死亡。患者大多神志清醒，严重的呼吸困难会给患者带来极大痛苦，有时，带有泡沫的咳嗽是肺损伤的早期和主要症状。