不少人喝牛奶后常拉肚子，是因为牛奶中含有乳糖，如果我们没有办法利用乳糖，无法使乳糖水解成葡萄糖和半乳糖，乳糖就堆积在肠道中，引起发酵，而产生腹涨、腹痛、腹泻的情形。我们常说这是乳糖不耐症。如果有这种情形饮食中只要避免喝牛奶及奶制品如冰淇淋、起司或蛋糕、西点、布丁等即可，若是婴儿尽可能喂哺母奶或使用商业不含乳糖的配方。
   乳醣不耐症是一种常见的营养吸收障碍，许多人喝牛奶后，因无法把乳醣分解成葡萄糖及半乳糖，以致肠内堆积大量短键脂肪酸及氢气，因而出现拉肚子、腹胀或腹绞痛等症状。这种现象是一种影响乳醣酵素活性的隐性基因所左右，不会因外界环境而改变，所以乳醣不耐症患者只能以不喝牛奶来避免拉肚子。
   而人体乳醣酵素在断奶期后才逐渐下降；因此，婴幼儿喝牛奶不会拉肚子，反而是在成年期以后才会有乳醣不耐症。调查显示，有这种问题者以东方人居多。若要避免乳醣不耐症的办法是，喝牛奶慢慢喝，或加两片面包，延长胃排空时间，或可降低拉肚子的机会。
  有人认为每天喝一些牛奶，能改善乳糖不耐的情形，但要因人而异。最好的方法是可以喝发酵过的乳制品如优酪乳，因为乳酸菌已经将乳糖分解了不必靠肠道的乳糖?分解，不过优酪乳的热量较高，所以最好选择原味的口味食用。 。