慢性附睾炎与慢性前列腺炎的症状类似，两者病程均较长，均有可能出现阴囊、下腹部和腹股沟等部位的疼痛不适感，疼痛症状时轻时重。虽然临床表现较类似，但两者仍较容易区分。慢性附睾炎体格检查可以附睾头部或尾部的肿大或结节，而慢性前列腺炎睾丸附睾大小形态一般正常，但前列腺液检查常有阳性。另外，泌尿系的彩超检查可以进行鉴别。