肺血栓的栓子主要来源于深静脉血栓形成。最常见下肢深静脉和盆腔静脉。如果静脉系统血液流速慢，血管内皮损伤，血液本身易凝集，这三要素更容易造成静脉血栓。有些人本身血液易凝集，这就是肺栓塞的原发高危因素，可通过一系列检查筛查。

而肥胖者、老年人 (尤其是高脂血症患者)、长期卧床、长时间静坐 (如通宵使用、通宵打麻将、长途乘飞机、火车、轮船等下肢少动者)，下肢血液流动缓慢，这就是肺栓塞的继发性危险因素。

育龄期妇女口服避孕药，会干扰机体凝血机制。妊娠妇女盆腔血被受增大子宫压迫，易产生盆腔静脉血栓。各种久立职业者 (如外科大夫、理发师) 也易形成下肢静脉曲张，曲张静脉很易形成血栓，也是肺栓塞高危因素之一。