果汁是由水果经压榨去掉残渣（膳食纤维）而制成，所以果汁中就基本不含膳食纤维，而膳食纤维对预防便秘、控制体重和抗癌都意义重大。另外在这个过程中，水果中一些易氧化的维生素（如维生素C）也会减少，厂家生产的果汁类饮料通常要经过高温消毒处理，不少营养成分也因此失去。因此，即使是纯果汁，其营养价值也与新鲜水果有很大差距。更何况，市场上大量的果汁类产品为了改善口感，人为地加入了很多糖、香精和防腐剂，果汁浓度也不足（20%左右居多），果汁饮料的营养价值与新鲜水果不可同日而语。且过量有一定的健康隐患，不建议你选用。
就算是自己榨的果汁也不能替代水果，2013年8月29日发表在《英国医学会杂志》上的一项大型前瞻性队列研究的报道。在这项研究中，美国研究者发现，蓝莓、西梅、苹果和雪梨等水果的摄入与2型糖尿病发病风险显著下降有关，但换算为等量的果汁后，却增加了风险。专家分析，这种差异与原只水果中丰富的膳食纤维有关。