因为避孕药含有人工合成的孕激素和少量雌激素药物，对胎儿有一定的危害，所以一般会建议停服避孕药后恢复正常月经周期3-6周再怀孕，也就是说最好是隔半年的样子再怀孕。停药期间，可以采用其它措施比如避孕药避孕。
如果在服药期间怀孕，怀孕后还继续服药，胎儿会受到合成孕激素的影响，发生女胎男性化，表现为阴蒂肥大、阴唇突起等，还可导致胎儿畸形，男胎和女胎均可能发生脊柱、气管、食管、肛门和四肢畸形。避孕药中的雌激素还会使女婴将来发生阴道透明细胞癌、宫颈腺癌等生殖道恶性肿瘤。