继发性肥胖症一般继发于「神经—内分泌—代谢紊乱」基础上，包括下丘脑性肥胖、垂体性肥胖、甲状腺性肥胖、肾上腺性肥胖、胰岛性肥胖等，如发生在下丘脑—垂体的感染、肿瘤、创伤、皮质醇增多症、甲状腺或性腺功能减退、胰岛素瘤等疾病都可导致继发性肥胖症。一些精神疾病（如抑郁症、进食异常等）和药物因素导致的肥胖，也属于继发性肥胖的范畴。