长期过量补钙对身体有一定的副作用，譬如大量补钙容易引起便秘，肾功能不全的人由于钙的排泄手影响会形成肾结石。长期大量摄取乳酸钙可引起疲劳、葡萄糖酸钙过多可能对糖尿病患者不利，大量服用碳酸钙可能出现高钙血症、恶心、呕吐及乏力等。
老年人如果盲目补钙会使骨骼不断钙化，反而会变得松脆。儿童服用钙片等产品也要小心，长期盲目地补充维生素D和钙，会抑制锌元素的吸收。某些疾病患者，也应该在医生指导下补钙，如心脏病患者不宜过量补钙，否则容易发生钙沉积而引发意外。
所以不宜长期补钙，且补钙最好以食补为主，并根据个人体质适当的运动，来增强对钙质的吸收。